『巨人の星』『いなかっぺ大將』で有名な川崎のぼるの漫畫が原作のスパイアクションアニメ。平凡な青年?隼太郎は、機密マイクロフィルムを狙う死の商人ゴーストの暗躍に巻き込まれ、母と妹を失う。彼は世界の悪と戦う日本國際秘密警察スカイヤーズに參加を志願し、Ｓ５號のコードネームでゴースト打倒を誓う。Ｓ１號ことキャプテンやＳ３號ユリなど４人の仲間そして愛犬ピーターと共に科學(xué)裝備で悪に挑むＳ５。彼の戦いの行方は？