哥斯拉破壞日本多年，〈G對策總部〉發(fā)明黑洞炮對付。但實(shí)驗(yàn)出意外，引來古代巨大昆蟲超翔龍重現(xiàn)，并攻擊哥斯拉。日本成了哥斯拉、超翔龍及人類三方的戰(zhàn)場。