為了奪取主人公等所在的宮國所持有的珍貴引擎，鄰國開始了日益激烈的侵略。為了迎擊敵國，宮國被迫將儀式用復(fù)座式飛行艇“Simoun”改造成了戰(zhàn)斗用戰(zhàn)艦。還需要未性別化的“巫女”被派遣擔(dān)任駕駛員，于是，她們成為了被稱為“coru”的戰(zhàn)斗小隊成員。 　　操縱“Simoun”的少數(shù)少女被稱為了“Simoun·シヴュラ（西貝拉）”因為擁有著特殊能力，她們可以選擇自己成為大人的時間。但是因為戰(zhàn)爭的爆發(fā)，她們的優(yōu)秀才能不得不運用在“Simoun”的操作上，換句話說，她們被強迫保持在了“少女階段”……