鋭利と珀は新人サクラ候補生の白崎、悠里、間宮、有賀に、サクラになるべく厳しい訓練を日々施していた。そんな中、事務次官補佐が何者かに射殺された事件で、新人4人は神北係長代理より初ミッションの指令を受ける。また任務を遂行するために、仮としてそれぞれメサイアが任命される。お互いのメサイアに戸惑いを隠しきれない新人達。一方、公安四係に身を置く三棲と周もこの事件を調査し始めた。