一艘隸屬美國的核潛艇在關(guān)島附近消失，后經(jīng)日本方面證實該潛艇已因事故遇難，而防衛(wèi)軍在調(diào)查過程中竟然還在海底發(fā)現(xiàn)巨大生物的存在。與此同時，新瀉妙高山、鹿兒島池田湖、小笠原諸島等地接連發(fā)生強烈的地震和人員傷亡事件，關(guān)于50年前那頭大鬧日本的哥斯拉的恐怖記憶相繼在人們的腦中復(fù)蘇。 　　BS電視臺女記者立花由里（新山千春 飾）近期正與同事調(diào)查接二連三的怪獸事件，從一個神秘老人的口中得知，所謂哥斯拉其實是太平洋戰(zhàn)爭中喪生的人們的冤魂聚集而成的怪獸，核潛艇事故引起的核泄漏似乎意外將哥斯拉喚醒。與它一同蘇醒的還有被稱為護國神獸的巴拉哥、摩斯拉、基多拉。日本本土面臨空前的災(zāi)難……