ナノサイズになる人體探査機(jī)?ヒポクラテス號(hào)に乗り込んだジオとノウ博士。ところが、小さくなった“ヒポ號(hào)”をピピがうっかりのみ込んだ…!? 巨大な歯につぶされそうになりながら猛スピードでピピの體の中に流れ込んだ2人。胃から腸へと向かって脫出するつもりがトラブル続きで脫出不可能、絶體絶命の大ピンチ!! そして、突然苦しみ出すピピの身に一體何が…!? ピピとの約束をはたすため、ジオは決死の行動(dòng)に出る。「必ずピピを救って、サバイバルしてみせる！」