少年仲人無意中闖入了綾小路博士的實驗室，陰差陽錯地啟動了博士研究的鋼鐵天使胡桃，而胡桃也只把仲人視為主人，對他唯命是從，軍隊為了收回胡桃，先后派了另兩位鋼鐵天使莎奇和佳玲加，但都失敗了。原來整件事背后還有一個組織在操控著，而且博士也被他們劫走了，為了找出答案，仲人和胡桃一行人起身前往博士的秘密實驗室。