在不遠(yuǎn)的未來，海平面原因不明地急速上升，導(dǎo)致了地表多數(shù)都沉入海中。 　　小時候因為事故而失去一條腿的少年?斑鳩夏生，厭倦了都市的生活，移居到了海邊的鄉(xiāng)村小鎮(zhèn)。曾經(jīng)身為海洋地質(zhì)學(xué)家的祖母留給他的、就只有船、潛水艇還有債務(wù)。 　　夏生為了取回“失去的未來”，與迷之討債人凱瑟琳一起，潛海前往據(jù)說保存著祖母遺產(chǎn)的海底倉庫。 　　在那里，他遇到了一位沉睡在如同棺材一般裝置中不可思議的少女“亞托莉”。她是一位構(gòu)造精密到與人類別無二致，而又豐富感情的機器人。 　　從海底被打撈起來的亞托莉如是說到： 　　“我想完成主人留給我的最后的命令。在此之前，我會成為夏生先生的腿！” 　　在一個逐漸沉入海中的平和小鎮(zhèn)，少年和機器人少女的難忘夏日就這么開始了。