森林大火，當(dāng)?shù)貎擅俦灰u擊，外星反叛者偽裝成老警官模樣混跡人群。老警官的兒子比利三年前因外星綁架事件同穆德（David Duchovny 大衛(wèi)·杜楚尼 飾）、斯科莉（Gillian Anderson 吉蓮·安德森 飾）相識(shí)，他約見二人尋找消失的副官。兩人經(jīng)初步調(diào)查，發(fā)現(xiàn)副官及其妻子皆曾被外星人綁架。認(rèn)定此事與外星反叛者有關(guān)。 　　另一方面，癌人生命將盡，為找到外星飛船，他釋放了關(guān)押在突尼斯監(jiān)獄的K（Nicholas Lea 尼古拉斯·李 飾）。聯(lián)邦調(diào)查局內(nèi)部不滿意穆德的形式方式，調(diào)派K接替X檔案的工作。為保護(hù)斯科莉不再遭遇綁架，穆德只得同Skinner（Mitch Pileggi 飾）私下前往森林調(diào)查……